Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDE4DQ08499 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms