Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col9a2Q07643 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Col9a2Q07643 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms