Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Col17a1Q07563 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Col17a1Q07563 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Col17a1Q07563 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Col17a1Q07563 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Col17a1Q07563 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Col17a1Q07563 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Col17a1Q07563 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Col17a1Q07563 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Col17a1Q07563 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Col17a1Q07563 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Col17a1Q07563 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Col17a1Q07563 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Col17a1Q07563 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Col17a1Q07563 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Col17a1Q07563 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Col17a1Q07563 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Col17a1Q07563 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Col17a1Q07563 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Col17a1Q07563 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Col17a1Q07563 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Col17a1Q07563 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Col17a1Q07563 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Col17a1Q07563 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Col17a1Q07563 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Col17a1Q07563 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Col17a1Q07563 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Col17a1Q07563 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Col17a1Q07563 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Col17a1Q07563 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Col17a1Q07563 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Col17a1Q07563 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Col17a1Q07563 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Col17a1Q07563 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Col17a1Q07563 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Col17a1Q07563 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Col17a1Q07563 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Col17a1Q07563 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Col17a1Q07563 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Col17a1Q07563 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Col17a1Q07563 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Col17a1Q07563 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Col17a1Q07563 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Col17a1Q07563 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Col17a1Q07563 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Col17a1Q07563 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms