Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms