Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apoc2Q05020 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apoc2Q05020 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms