Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Sox13Q04891 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox13Q04891 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms