Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scg2Q03517 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scg2Q03517 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms