Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col6a2Q02788 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col6a2Q02788 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms