Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gja5Q01231 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja5Q01231 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja5Q01231 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja5Q01231 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja5Q01231 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja5Q01231 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja5Q01231 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja5Q01231 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja5Q01231 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja5Q01231 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja5Q01231 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja5Q01231 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja5Q01231 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja5Q01231 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja5Q01231 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja5Q01231 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja5Q01231 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja5Q01231 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja5Q01231 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja5Q01231 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja5Q01231 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja5Q01231 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja5Q01231 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja5Q01231 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja5Q01231 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja5Q01231 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja5Q01231 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja5Q01231 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja5Q01231 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja5Q01231 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja5Q01231 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja5Q01231 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gja5Q01231 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gja5Q01231 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gja5Q01231 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms