Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabpb1Q00420 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms