Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pax8Q00288 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax8Q00288 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms