Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbp10Q000W5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbp10Q000W5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbp10Q000W5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp10Q000W5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp10Q000W5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp10Q000W5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp10Q000W5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp10Q000W5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp10Q000W5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp10Q000W5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp10Q000W5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp10Q000W5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp10Q000W5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp10Q000W5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp10Q000W5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp10Q000W5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp10Q000W5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp10Q000W5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp10Q000W5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp10Q000W5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp10Q000W5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp10Q000W5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp10Q000W5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp10Q000W5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp10Q000W5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp10Q000W5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp10Q000W5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbp10Q000W5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbp10Q000W5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbp10Q000W5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbp10Q000W5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbp10Q000W5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbp10Q000W5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbp10Q000W5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbp10Q000W5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbp10Q000W5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gbp10Q000W5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms