Protein–RNA interactions for Protein: P97760

Polr2c, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2cP97760 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr2cP97760 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr2cP97760 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr2cP97760 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr2cP97760 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr2cP97760 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr2cP97760 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr2cP97760 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr2cP97760 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr2cP97760 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr2cP97760 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr2cP97760 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr2cP97760 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr2cP97760 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr2cP97760 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr2cP97760 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr2cP97760 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr2cP97760 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr2cP97760 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr2cP97760 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr2cP97760 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr2cP97760 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr2cP97760 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr2cP97760 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr2cP97760 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms