Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Npas1P97459 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Npas1P97459 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Npas1P97459 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Npas1P97459 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Npas1P97459 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas1P97459 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas1P97459 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Npas1P97459 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Npas1P97459 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms