Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkx2-3P97334 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkx2-3P97334 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkx2-3P97334 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkx2-3P97334 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkx2-3P97334 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkx2-3P97334 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkx2-3P97334 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkx2-3P97334 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkx2-3P97334 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx2-3P97334 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms