Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arf1P84078 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arf1P84078 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arf1P84078 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arf1P84078 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Arf1P84078 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Arf1P84078 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Arf1P84078 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Arf1P84078 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Arf1P84078 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arf1P84078 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arf1P84078 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arf1P84078 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arf1P84078 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arf1P84078 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms