Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr1bP70700 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms