Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrig1P70193 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrig1P70193 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms