Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tubb4bP68372 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tubb4bP68372 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Tubb4bP68372 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tubb4bP68372 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tubb4bP68372 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb4bP68372 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb4bP68372 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb4bP68372 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb4bP68372 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb4bP68372 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb4bP68372 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb4bP68372 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb4bP68372 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb4bP68372 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb4bP68372 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb4bP68372 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb4bP68372 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb4bP68372 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tubb4bP68372 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb4bP68372 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb4bP68372 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb4bP68372 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb4bP68372 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb4bP68372 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb4bP68372 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb4bP68372 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb4bP68372 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb4bP68372 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb4bP68372 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb4bP68372 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb4bP68372 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb4bP68372 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb4bP68372 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tubb4bP68372 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tubb4bP68372 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tubb4bP68372 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms