Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acta1P68134 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acta1P68134 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acta1P68134 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acta1P68134 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acta1P68134 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acta1P68134 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acta1P68134 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acta1P68134 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms