Protein–RNA interactions for Protein: P63163

Snrpn, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpnP63163 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SnrpnP63163 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SnrpnP63163 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SnrpnP63163 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SnrpnP63163 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SnrpnP63163 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SnrpnP63163 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SnrpnP63163 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SnrpnP63163 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SnrpnP63163 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SnrpnP63163 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SnrpnP63163 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SnrpnP63163 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SnrpnP63163 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SnrpnP63163 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SnrpnP63163 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SnrpnP63163 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SnrpnP63163 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SnrpnP63163 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SnrpnP63163 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SnrpnP63163 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SnrpnP63163 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms