Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gabrb3P63080 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155 ms