Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Csrnp1P59054 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csrnp1P59054 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csrnp1P59054 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csrnp1P59054 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csrnp1P59054 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csrnp1P59054 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csrnp1P59054 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csrnp1P59054 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csrnp1P59054 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csrnp1P59054 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csrnp1P59054 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csrnp1P59054 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csrnp1P59054 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csrnp1P59054 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csrnp1P59054 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csrnp1P59054 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csrnp1P59054 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csrnp1P59054 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csrnp1P59054 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csrnp1P59054 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csrnp1P59054 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csrnp1P59054 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csrnp1P59054 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csrnp1P59054 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csrnp1P59054 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csrnp1P59054 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csrnp1P59054 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csrnp1P59054 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csrnp1P59054 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csrnp1P59054 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csrnp1P59054 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csrnp1P59054 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csrnp1P59054 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csrnp1P59054 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csrnp1P59054 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csrnp1P59054 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csrnp1P59054 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms