Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtnsP57757 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CtnsP57757 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtnsP57757 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtnsP57757 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CtnsP57757 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtnsP57757 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtnsP57757 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtnsP57757 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtnsP57757 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms