Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irf5P56477 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Irf5P56477 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irf5P56477 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irf5P56477 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf5P56477 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf5P56477 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Irf5P56477 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Irf5P56477 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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