Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2e3P52483 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms