Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms