Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl5P50228 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcl5P50228 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms