Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psen1P49769 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psen1P49769 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psen1P49769 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psen1P49769 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psen1P49769 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psen1P49769 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psen1P49769 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psen1P49769 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psen1P49769 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psen1P49769 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psen1P49769 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms