Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gbx2P48031 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms