Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syt1P46096 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syt1P46096 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Syt1P46096 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Syt1P46096 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syt1P46096 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syt1P46096 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syt1P46096 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syt1P46096 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syt1P46096 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syt1P46096 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syt1P46096 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms