Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mmp9P41245 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp9P41245 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms