Protein–RNA interactions for Protein: P40336

Vps26a, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps26aP40336 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps26aP40336 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vps26aP40336 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps26aP40336 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms