Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col18a1P39061 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col18a1P39061 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col18a1P39061 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col18a1P39061 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col18a1P39061 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col18a1P39061 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col18a1P39061 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col18a1P39061 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col18a1P39061 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col18a1P39061 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col18a1P39061 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col18a1P39061 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Col18a1P39061 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Col18a1P39061 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col18a1P39061 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col18a1P39061 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col18a1P39061 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Col18a1P39061 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col18a1P39061 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col18a1P39061 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col18a1P39061 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col18a1P39061 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col18a1P39061 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col18a1P39061 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col18a1P39061 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col18a1P39061 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col18a1P39061 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col18a1P39061 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col18a1P39061 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col18a1P39061 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col18a1P39061 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Col18a1P39061 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col18a1P39061 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col18a1P39061 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col18a1P39061 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col18a1P39061 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col18a1P39061 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col18a1P39061 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Col18a1P39061 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col18a1P39061 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col18a1P39061 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col18a1P39061 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Col18a1P39061 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Col18a1P39061 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Col18a1P39061 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col18a1P39061 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col18a1P39061 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col18a1P39061 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col18a1P39061 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col18a1P39061 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col18a1P39061 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col18a1P39061 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Col18a1P39061 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col18a1P39061 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col18a1P39061 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Col18a1P39061 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col18a1P39061 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col18a1P39061 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col18a1P39061 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col18a1P39061 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col18a1P39061 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col18a1P39061 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col18a1P39061 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col18a1P39061 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col18a1P39061 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms