Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lig1P37913 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lig1P37913 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lig1P37913 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lig1P37913 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lig1P37913 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lig1P37913 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Lig1P37913 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lig1P37913 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lig1P37913 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lig1P37913 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms