Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PpardP35396 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PpardP35396 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PpardP35396 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PpardP35396 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PpardP35396 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PpardP35396 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PpardP35396 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PpardP35396 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PpardP35396 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PpardP35396 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PpardP35396 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PpardP35396 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PpardP35396 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PpardP35396 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PpardP35396 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PpardP35396 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PpardP35396 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PpardP35396 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PpardP35396 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PpardP35396 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PpardP35396 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PpardP35396 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PpardP35396 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PpardP35396 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PpardP35396 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PpardP35396 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PpardP35396 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PpardP35396 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PpardP35396 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PpardP35396 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PpardP35396 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PpardP35396 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PpardP35396 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PpardP35396 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PpardP35396 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PpardP35396 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PpardP35396 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PpardP35396 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PpardP35396 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PpardP35396 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PpardP35396 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PpardP35396 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PpardP35396 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PpardP35396 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PpardP35396 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PpardP35396 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PpardP35396 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PpardP35396 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PpardP35396 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PpardP35396 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PpardP35396 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PpardP35396 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PpardP35396 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PpardP35396 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PpardP35396 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PpardP35396 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PpardP35396 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PpardP35396 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PpardP35396 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PpardP35396 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PpardP35396 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PpardP35396 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PpardP35396 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PpardP35396 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PpardP35396 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PpardP35396 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PpardP35396 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PpardP35396 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PpardP35396 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PpardP35396 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PpardP35396 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PpardP35396 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PpardP35396 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PpardP35396 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PpardP35396 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PpardP35396 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PpardP35396 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PpardP35396 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PpardP35396 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PpardP35396 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PpardP35396 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PpardP35396 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PpardP35396 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PpardP35396 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PpardP35396 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PpardP35396 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PpardP35396 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PpardP35396 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PpardP35396 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PpardP35396 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PpardP35396 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PpardP35396 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PpardP35396 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PpardP35396 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PpardP35396 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PpardP35396 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PpardP35396 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PpardP35396 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PpardP35396 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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