Protein–RNA interactions for Protein: P31648

Slc6a1, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a1P31648 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a1P31648 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc6a1P31648 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc6a1P31648 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc6a1P31648 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a1P31648 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a1P31648 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a1P31648 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a1P31648 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a1P31648 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a1P31648 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a1P31648 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a1P31648 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a1P31648 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a1P31648 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a1P31648 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms