Protein–RNA interactions for Protein: P29594

Casp2, Caspase-2, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp2P29594 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp2P29594 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp2P29594 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp2P29594 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Casp2P29594 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Casp2P29594 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casp2P29594 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Casp2P29594 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casp2P29594 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casp2P29594 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casp2P29594 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casp2P29594 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casp2P29594 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casp2P29594 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casp2P29594 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casp2P29594 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casp2P29594 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casp2P29594 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casp2P29594 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casp2P29594 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casp2P29594 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casp2P29594 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casp2P29594 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Casp2P29594 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casp2P29594 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casp2P29594 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casp2P29594 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casp2P29594 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casp2P29594 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casp2P29594 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casp2P29594 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Casp2P29594 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casp2P29594 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casp2P29594 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casp2P29594 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casp2P29594 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casp2P29594 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp2P29594 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp2P29594 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp2P29594 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp2P29594 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp2P29594 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp2P29594 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp2P29594 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp2P29594 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp2P29594 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp2P29594 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp2P29594 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp2P29594 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp2P29594 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp2P29594 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp2P29594 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp2P29594 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms