Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NapbP28663 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NapbP28663 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NapbP28663 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NapbP28663 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NapbP28663 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NapbP28663 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NapbP28663 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NapbP28663 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NapbP28663 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NapbP28663 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NapbP28663 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NapbP28663 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NapbP28663 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NapbP28663 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NapbP28663 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NapbP28663 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NapbP28663 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NapbP28663 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NapbP28663 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NapbP28663 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NapbP28663 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NapbP28663 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NapbP28663 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NapbP28663 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NapbP28663 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NapbP28663 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NapbP28663 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NapbP28663 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NapbP28663 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NapbP28663 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NapbP28663 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NapbP28663 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NapbP28663 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NapbP28663 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NapbP28663 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NapbP28663 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NapbP28663 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NapbP28663 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NapbP28663 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NapbP28663 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NapbP28663 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NapbP28663 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NapbP28663 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NapbP28663 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NapbP28663 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NapbP28663 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NapbP28663 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NapbP28663 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NapbP28663 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NapbP28663 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NapbP28663 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NapbP28663 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NapbP28663 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NapbP28663 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NapbP28663 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NapbP28663 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NapbP28663 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NapbP28663 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NapbP28663 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NapbP28663 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NapbP28663 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NapbP28663 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NapbP28663 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NapbP28663 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NapbP28663 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NapbP28663 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NapbP28663 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NapbP28663 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NapbP28663 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NapbP28663 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NapbP28663 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NapbP28663 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NapbP28663 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NapbP28663 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NapbP28663 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NapbP28663 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NapbP28663 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NapbP28663 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NapbP28663 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NapbP28663 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NapbP28663 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NapbP28663 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NapbP28663 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NapbP28663 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NapbP28663 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NapbP28663 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NapbP28663 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NapbP28663 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NapbP28663 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NapbP28663 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NapbP28663 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NapbP28663 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NapbP28663 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NapbP28663 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NapbP28663 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NapbP28663 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NapbP28663 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NapbP28663 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NapbP28663 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms