Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vav1P27870 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vav1P27870 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vav1P27870 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vav1P27870 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vav1P27870 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vav1P27870 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vav1P27870 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vav1P27870 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vav1P27870 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vav1P27870 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vav1P27870 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vav1P27870 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vav1P27870 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vav1P27870 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vav1P27870 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vav1P27870 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vav1P27870 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vav1P27870 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms