Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms