Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk1P22518 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk1P22518 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk1P22518 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk1P22518 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clk1P22518 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Clk1P22518 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clk1P22518 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clk1P22518 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clk1P22518 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clk1P22518 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clk1P22518 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clk1P22518 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clk1P22518 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clk1P22518 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms