Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

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Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csn1s1P19228 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms