Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18532 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P18532 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18532 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18532 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18532 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18532 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18532 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P18532 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P18532 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P18532 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P18532 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18532 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18532 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18532 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18532 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18532 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18532 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P18532 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18532 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18532 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18532 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18532 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18532 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18532 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18532 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18532 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18532 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18532 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18532 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18532 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18532 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18532 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18532 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18532 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18532 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18532 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18532 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18532 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18532 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18532 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P18532 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18532 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18532 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18532 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18532 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18532 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P18532 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P18532 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18532 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18532 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18532 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18532 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18532 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18532 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18532 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18532 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18532 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18532 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18532 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18532 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18532 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18532 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18532 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18532 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18532 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18532 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18532 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18532 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18532 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18532 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P18532 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P18532 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18532 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18532 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18532 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18532 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18532 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18532 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P18532 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18532 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18532 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18532 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18532 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18532 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P18532 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P18532 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P18532 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P18532 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18532 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18532 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18532 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P18532 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18532 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18532 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18532 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18532 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18532 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18532 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18532 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms