Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18525 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18525 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18525 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18525 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18525 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18525 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18525 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18525 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18525 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18525 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18525 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18525 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18525 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18525 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18525 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18525 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18525 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18525 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18525 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18525 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P18525 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18525 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18525 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18525 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18525 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18525 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18525 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P18525 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18525 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18525 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18525 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18525 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18525 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18525 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18525 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18525 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18525 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18525 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18525 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18525 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P18525 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18525 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18525 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18525 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18525 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18525 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18525 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P18525 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18525 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18525 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P18525 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18525 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18525 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18525 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18525 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18525 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18525 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18525 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18525 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18525 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18525 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18525 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P18525 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18525 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18525 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18525 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18525 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18525 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18525 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18525 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P18525 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18525 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18525 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18525 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18525 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18525 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18525 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18525 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18525 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18525 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18525 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18525 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18525 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P18525 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18525 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P18525 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P18525 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18525 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18525 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18525 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18525 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P18525 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P18525 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P18525 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
P18525 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P18525 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P18525 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P18525 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P18525 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms