Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra6P16305 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra6P16305 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms