Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga5P11688 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga5P11688 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga5P11688 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga5P11688 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga5P11688 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga5P11688 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga5P11688 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga5P11688 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga5P11688 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms