Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fv4P11370 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fv4P11370 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fv4P11370 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fv4P11370 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fv4P11370 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fv4P11370 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fv4P11370 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fv4P11370 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fv4P11370 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fv4P11370 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fv4P11370 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fv4P11370 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms