Protein–RNA interactions for Protein: P10922

H1f0, Histone H1.0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H1f0P10922 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H1f0P10922 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H1f0P10922 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H1f0P10922 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H1f0P10922 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H1f0P10922 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H1f0P10922 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H1f0P10922 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms