Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ly6c1P0CW02 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms